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  2. 《Nature》科研數(shù)據(jù)管理很重要!應(yīng)拿出5%研究經(jīng)費(fèi)
    2020-03-09 09:39:16 作者:本網(wǎng)整理 來源:材料科學(xué)網(wǎng) 分享至:

    日前,《Nature》期刊發(fā)文稱:5%的研究經(jīng)費(fèi)應(yīng)用于確保科研數(shù)據(jù)可重復(fù)利用(鼓勵重復(fù)性研究和無效結(jié)果)。荷蘭 Barend Mons教授認(rèn)為只撥經(jīng)費(fèi)支持研究而不負(fù)責(zé)數(shù)據(jù)管理是不負(fù)責(zé)任的。目前對科研數(shù)據(jù)管理有著迫切需求。應(yīng)該對 科研數(shù)據(jù)管理投入部分管理經(jīng)費(fèi),并且聘用專業(yè)的數(shù)據(jù)管理人員,利用專業(yè)的數(shù)據(jù)管理工具對科研數(shù)據(jù)進(jìn)行科學(xué)管理 ,這不僅能解放科研人員獲得更多的時間,以便更加投入研究工作,并且使得科研人員具有進(jìn)一步利深入挖掘?qū)嶒?yàn)數(shù) 據(jù)進(jìn)行科學(xué)分析。

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    Nature 578, 491 (2020)


    Barend Mons教授提出了FAIR法則(即可找到,可訪問,可互操作和可再利用)作為科研數(shù)據(jù)管理的基本準(zhǔn)則。并且其 同仁和荷蘭政府制定了相關(guān)政策,目前正處于初步實(shí)施階段。國際上其他國家也開始逐漸在科研數(shù)據(jù)管理領(lǐng)域加大投 入。Barend Mons教授還呼吁,利用項(xiàng)目研究經(jīng)費(fèi)的5%作為項(xiàng)目管理經(jīng)費(fèi),并且項(xiàng)目負(fù)責(zé)人在申請項(xiàng)目時必須提交詳細(xì) 的科研數(shù)據(jù)管理方案。項(xiàng)目資助方也應(yīng)該要求項(xiàng)目實(shí)施方進(jìn)行此項(xiàng)管理,否則不予以資助。這種科學(xué)的管理方式將使 得科研的產(chǎn)出比更高。


    這種管理方式特別適用于目前高校和研究所的實(shí)際情況。高校中學(xué)生們自己管理自己的實(shí)驗(yàn)和研究數(shù)據(jù),這不僅分散 了學(xué)生的經(jīng)理,不利于深入開展研究工作。并且導(dǎo)致學(xué)生往往只關(guān)注對自己實(shí)驗(yàn)結(jié)果有利的部分?jǐn)?shù)據(jù),缺乏對實(shí)驗(yàn)數(shù) 據(jù)的深層次挖掘,一定程度上造成實(shí)驗(yàn)研究的不全面。因此,專職的數(shù)據(jù)管理人員在科研中十分必要。


    許多棘手的問題只有通過數(shù)據(jù)密集型計(jì)算機(jī)輔助研究才能解決。絕大多數(shù)研究數(shù)據(jù)從未發(fā)布過。因?yàn)闊o法重復(fù)使用這 些數(shù)據(jù)而浪費(fèi)了巨額研發(fā)資金。 數(shù)據(jù)再利用的相關(guān)政策已經(jīng)有了,但是解決該問題所需要的資源可能是科學(xué)界難以面 對的。


    2013年,Barend Mons教授作為荷蘭專家小組的一員并且呼吁國家科學(xué)研究資助支持?jǐn)?shù)據(jù)管理。七年后,協(xié)助起草的相 關(guān)政策開始實(shí)施。要求設(shè)備和研究人員創(chuàng)建的數(shù)據(jù)需滿足FAIR原則。 目前Barend Mons教授主導(dǎo)一個國際全球開放展 覽會(FAIR)辦公室,負(fù)責(zé)幫助研究團(tuán)隊(duì)實(shí)施這一準(zhǔn)則。并且認(rèn)為這個舉措將需要大量的專業(yè)數(shù)據(jù)管理人員,估計(jì)約 每20名研究人員中就需要一個數(shù)據(jù)管理人員。


    即使數(shù)據(jù)共享,也缺少重復(fù)使用所需的原始數(shù)據(jù)、專業(yè)知識、技術(shù)支持以及基礎(chǔ)設(shè)施。大多數(shù)已公開發(fā)表的數(shù)據(jù)集分 散在“補(bǔ)充文件”中,而補(bǔ)充文件中的數(shù)據(jù)是難以找到并且重復(fù)利用。這種做法使研究人員之間無法互相借鑒。例如 ,在疾病暴發(fā)的情況下,數(shù)據(jù)的確實(shí)可能造成死亡人數(shù)增加。


    Barend Mons教授認(rèn)為研究經(jīng)費(fèi)的5%應(yīng)該用于數(shù)據(jù)管理。歐盟有3000億歐元(3250億美元)的公共資金用于研究,因 此在數(shù)據(jù)管理上應(yīng)話費(fèi)150億歐元。而研究人員,尤其是經(jīng)驗(yàn)更豐富的科學(xué)家認(rèn)為這使得研究經(jīng)費(fèi)減少了5%。


    首先,妥善保管數(shù)據(jù)是一項(xiàng)道德責(zé)任,應(yīng)成為良好研究實(shí)踐的一部分。第二,如果數(shù)據(jù)得到適當(dāng)處理,研究人員將有 更多時間進(jìn)行研究。攻讀博士學(xué)位的學(xué)生最多將80%的時間花在“數(shù)據(jù)處理”上,不應(yīng)將時間浪費(fèi)在修改格式等小錯 誤使數(shù)據(jù)適合分析。如果有400名這樣的學(xué)生,那將至少相當(dāng)于200名全職雇員的薪水。因此,雇用20名專業(yè)數(shù)據(jù)管理 員來減少因數(shù)據(jù)爭用而浪費(fèi)的時間將提高有效的研究能力。許多頂級大學(xué)開始意識到不共享數(shù)據(jù)的代價是巨大的,并 且要大于相關(guān)的風(fēng)險。而科學(xué)的數(shù)據(jù)管理可提供可觀的投資回報。

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    歐盟委員會2018年的一份報告估計(jì),僅在學(xué)術(shù)領(lǐng)域,數(shù)據(jù)再利用問題每年就給歐盟造成至少100億歐元的損失,以及 160億歐元的創(chuàng)新機(jī)會損失。 


    如今,F(xiàn)AIR指導(dǎo)原則每天被引用3次,但引用并不等同已經(jīng)應(yīng)用于實(shí)踐。Barend Mons教授和她的同事們以及歐洲開放 科學(xué)云(European Open ScienceCloud)是一項(xiàng)旨在促進(jìn)開放科學(xué)實(shí)踐的計(jì)劃,其范圍涉及整個大陸范圍的數(shù)據(jù)共享 基礎(chǔ)架構(gòu)的要求。據(jù)估計(jì),在歐洲的7000萬科技專業(yè)人員和170萬研究人員中,歐洲將至少有1000萬嚴(yán)肅數(shù)據(jù)生成者。 因此,我們將需要教育大約500,000種各種類型的數(shù)據(jù)管理員,以通過實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)和數(shù)據(jù)捕獲,管理,存儲,分析,發(fā)布 和重用為研究人員提供支持。


    由于數(shù)據(jù)管理太過于繁雜且耗時,不能留給研究人員去做。很少有研究人員將數(shù)據(jù)管理作為他們的核心業(yè)務(wù),特別是 當(dāng)前的激勵機(jī)制不鼓勵數(shù)據(jù)共享,并鞏固了古老的和幾乎完全基于敘事的學(xué)術(shù)交流文化。幸運(yùn)的是,世界各地的研究 機(jī)構(gòu)正在建立數(shù)據(jù)競爭力中心以提供幫助,其中包括荷蘭的瓦赫寧根大學(xué)和意大利都靈大學(xué)的數(shù)據(jù)中心。但是這個運(yùn) 動還處于起步階段。


    研究資助機(jī)構(gòu)應(yīng)堅(jiān)持:如果沒有經(jīng)過適當(dāng)審查和預(yù)算的數(shù)據(jù)管理計(jì)劃,就不再撥付研究經(jīng)費(fèi)。 而FAIR數(shù)據(jù)可以提供更 有效的人工智能(FAIR也可以意味著“完全AI就緒”),這將開創(chuàng)前所未有的研究機(jī)會并提高可重復(fù)性。


    一些數(shù)據(jù)密集型組織正在數(shù)據(jù)管理方面加大投入,例如制藥公司和醫(yī)療中心。(注意FAIR與“公開”不同;保密規(guī)則 仍然適用。)在萊頓大學(xué),一個計(jì)算腫瘤學(xué)程序可為患者體內(nèi)分析的每個腫瘤創(chuàng)建一個機(jī)器可操作的信息文件,無需 手動干預(yù)。該項(xiàng)目預(yù)算的大約10%用于這些文件的設(shè)計(jì)和管理,我們稱之為FAIR數(shù)字雙胞胎。


    更多的研究機(jī)構(gòu)和項(xiàng)目資助方必須做出類似的承諾。關(guān)鍵是數(shù)據(jù)管理能力的建設(shè),使各個研究團(tuán)隊(duì)能夠在國內(nèi)和國際 上進(jìn)行合作并共享好的實(shí)踐,以便使得數(shù)據(jù)管理成為良好的規(guī)則,而非負(fù)擔(dān)。

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