2023年啟動的新一輪院士制度改革中，院士增選的推薦機制和評選流程發生了顯著變化。

院士推薦方面：

新修訂的兩院章程稱，院士增選實行推薦制，候選人由院士和學術團體推薦。具體而言，在推薦環節，根據兩院2023和2025年發布的院士增選工作實施辦法，每位院士只能推薦一位候選人。對65歲以下的候選人，2023年以前需要三位院士的聯合提名才能入選，現在只需一位來自本學部或專業相近的院士推薦即可。院士手中的“推薦票”從三票降為一票。通過限制名額，院士在推薦候選人時將更慎重，提名的含金量得以提高，避免了“湊數”現象。

評選流程方面：

2023年前，院士評選要經過兩輪評審：第一輪，在學部內，由學部常委會組織各專業組和學部全體會議，對被提名人進行評審，產生一份正式候選人名單，隨后，各學部再根據當年分配下來的名額，對這些正式候選人實行差額比例為20％的無記名投票，也就是說，候選人中的五分之四可以進入最終的全院投票環節。第二輪，舉行全院院士增選大會，終選采取等額選舉，無記名投票，獲得贊同票數超過投票院士人數二分之一的候選人當選。

改革之后的2023年，第一輪初選環節變為外部同行專家盲評，據悉，兩院都建立了外部專家數據庫，如長江學者、杰青等更廣的學術專家群體被納入其中。第一輪參評的外部同行以不參評的長江學者、“杰青”、“領軍人才”為主，也有部分海外華人學者，每個學部會按照不同專業領域來分組組織外部專家，每組幾十人，評審時采取封閉式管理，專家需要獨自評審材料和投票，監管嚴格，三餐飲食都是送飯上門。而且，評審投票的時間總體上被大幅壓縮，第一輪外部同行評審只用幾天就完成，此后立即進入第二輪大會投票環節，整個評審進程大大加快。

第二輪院士大會投票環節，新一輪改革也進行了調整，從過去的等額投票改為差額投票，規定參會院士按20％差額對候選人投票，獲得贊同票數超過投票人數二分之一的候選人，按各專業學部增選名額，根據得票數依序當選院士。由于過去第二輪是等額投票，最核心的篩選過程實際發生在學部內部初選階段。終選投票幾乎只是形式上的走過場，所以在大會投票日，盡管是全體投票，但許多院士不參加。